Etter den naturlige apokalypsen fløt elver over sine bredder og gater i byer ble omgjort til kanaler. Fullstendig anarki har kommet, myndighetene er handlingslammet, alle må overleve så godt de kan. Helten i spillet Hydro Storm 2 er ikke fremmed for å kjempe for livet. Han har allerede skaffet seg en hurtigvannscooter og er klar til å utføre ethvert oppdrag.