Konflikter har begynt i geléens verden, og alt fordi all geléen i spillet Jelly Pop er blandet og uten hjelp utenfra kan de ikke sorteres. Dette trenger de for å leve i verden i grupper, fordi de er allergiske mot hverandre. Hvor mange og hvilke som skal velges, vises på hvert nivå øverst på skjermen. Koble dem i lenker på tre eller flere for å spre Jelly Pop og fjerne dem fra feltet. Bruk boostere og prøv å holde deg innenfor et begrenset antall trekk.