En gruppe kuber av forskjellige farger som reiste rundt i verden falt i en felle. Heltene havnet i et fangehull, og du i spillet Zero Squares må hjelpe dem å komme seg ut av det. Foran deg på skjermen vil du se rommet der kuben din skal ligge. Du kan bruke kontrolltastene til å kontrollere handlingene. Et sted i rommet vil du se en portal som fører til neste nivå i spillet. Du må lede kuben langs en bestemt rute og sørge for at den kommer inn i portalen. På din vei kan det være hindringer som karakteren din må omgå.